独立行政法人水産総合研究センター（水研センター）は、各年度の業務実績を自ら評価し、その結果を農林水産省独立行政法人評価委員会に提出して、事業全体の総合的な評価を受けています。その評価にむけて、研究所では外部委員を加えて研究所運営会議及び小課題評価会議を開催しています。
センター機関評価会議の概要については、
水産総合研究センターのホームページ(http://www.fra.affrc.go.jp)を参照ください。
注
*センター機関評価会議
センター全体の運営及び研究に関する事項を評価（センター本部で実施）
*研究所運営会議
研究所の運営に関する協議（各研究所で実施。平成17年度までは研究所機関評価会議として実施）
*小課題評価会議
研究部（石垣支所）の研究課題を評価（各研究部で実施。平成17年度までは研究評価部会として実施）
■平成２１年度 研究所運営会議
■平成２０年度 研究所運営会議
■平成１９年度 研究所運営会議
■平成１８年度 研究所運営会議
■平成１７年度 研究所機関評価会議
■平成１６年度 研究所機関評価会議
■平成１５年度 研究所機関評価会議
■平成１４年度 研究所機関評価会議
■平成１３年度 研究所機関評価会議
